Organi Mednarodne fakultete za družbene in poslovne študije so:
Senat,
Akademski zbor,
Upravni odbor,
Dekan,
Direktor,
Študentski svet.
Senat
Senat je najvišji strokovni organ, ki ga sestavlja devet članov, in sicer sedem visokošolskih učiteljev in znanstvenih delavcev ter dva člana Študentskega sveta MFDPŠ. Dekan MFDPŠ je član Senata MFDPŠ po položaju.
Člani senata:
prof. dr. Daniel Melavc.
izr. prof. dr. Mitja I. Tavčar.
izr. prof. dr. Andrej Koren.
4. izr. prof. dr. Drago Dubrovski.
doc. dr. Kristijan Musek Lešnik.
doc. dr. Špelca Mežnar.
Dekan fakultete je član senata po funkciji.
predstavnici Študentskega sveta MFDPŠ (Tamara Novak ter Sara Rančan).
Akademski zbor
Akademski zbor MFDPŠ sestavljajo vsi visokošolski učitelji, znanstveni delavci ter visokošolski in raziskovalni sodelavci, ki sodelujejo v izobraževalnem in raziskovalnem procesu. Pri njegovem delu sodelujejo tudi predstavniki študentov, katerih število predstavlja petino članov Akademskega zbora.
Predsednik akademskega zbora: red. prof. dr. Daniel Melavc.
Namestnik predsednika akademskega zbora: doc. dr. Kristijan Musek Lešnik.
Upravni odbor
Upravni odbor MFDPŠ je upravljalni organ fakultete in ima pet članov. Sestavljajo ga trije predstavniki ustanovitelja, predstavnik visokošolskih učiteljev oz. drugih delavcev fakultete in predstavnik gospodarstva oz. lokalne skupnosti.
Predsednik upravnega odbora: mag. Matjaž Pajk.
Namestnica predsednika upravnega odbora: Vilma Alina Bezenšek, univ. dipl. prav.
Ostali člani:
Aleksander Svetelšek, dipl. ekon.
Stanislav Rozman, univ. dipl. zgo.
mag. Valerij Dermol.
Dekan
Dekan MFDPŠ je poslovodni organ in strokovni vodja fakultete. Dekan doc. dr. Srečko Natek je bil imenovan na 11. seji Upravnega odbora MFDPŠ dne, 23. 6. 2008.
Direktor
Direktor je organ MFDPŠ, ki predstavlja in zastopa fakulteto po pooblastilu dekana. Direktorica Anja Lesjak, univ. dipl. ekon. je bila imenovana na 15. seji Upravnega odbora MFDPŠ dne, 25. 9. 2009.
Študentski svet
Študentski svet MFDPŠ je predstavniški organ študentov MFDPŠ, določen z Zakonom o visokem šolstvu, Statutom MFDPŠ in Pravilnikom študentskega sveta. Študentski svet sestavlja devet študentov, predstavnikov dodiplomskih in podiplomskih študijskih programov. Študentski svet na prvi seji z večino glasov svojih članov izvoli predsednika, namestnika predsednika, dva člana Senata, enega člana Komisije za študentske zadeve in petino predstavnikov študentov v Akademskem zboru MFDPŠ, če poseben pravilnik ne določa drugače.
Rebeka Drnovšek - predsednica študentskega sveta
Tamara Novak - podpredsednica študentskega sveta
Tina Hrastnik - tajnica študentskega sveta
Andreja Snedič Jurak - članica senata
Katja Simerl - članica senata
Sara Rančan - članica komisije za študentske zadeve
